| 年月日 | 協議状況・経過等 |
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| 1999年1月 | 合併に関する住民アンケートの結果「合併は必要(55.4％)」 |
| 1999年6月16日 | 研究会「対馬地方地方分権・市町村合併等調査研究会」設置 |
| 2000年1月 | 合併に関する住民アンケート(6町住民約1500人対象)の結果 |
| 合併の是非：「必要(72.9％)」「必要ない(12％)」 |
| 枠組み：「下県郡3町,上県郡3町でそれぞれ合併(26％)」「厳原町と美津島町,豊玉町と峰町,上県町と上対馬町がそれぞれ合併(25％)」「対馬6町(21％)」「厳原町と美津島町の2町,豊玉町,峰町,上県町,上対馬町の4町で合併(9％)」「その他(4％)」 |
| 2000年4月18日 | 準備会設置 |
| 2000年8月1日 | 法定協議会設置 |
| 新市名公募上位7点：対馬,つしま,対州(たいしゅう),新対馬(しんつしま),六対馬(むつしま),むつしま,新つしま |
| 新市名最終候補3点：対馬,つしま,国境(こっきょう) |
| 新市名：対馬市(つしまし) |
| 市役所：厳原町役場 |
| 2002年6月11日 | 合併協定調印式 |
| 2002年6月12日 | 合併関連議案を6町が可決 |
| 2002年10月2日 | 合併関連議案を長崎県議会が可決 |
| 2002年11月27日 | 官報告示 |
