| 年月日 | 協議状況・経過等 |
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| 2001年7月18日 | 西之表市,熊毛郡上屋久町,屋久町と5市町で研究会「熊毛地区市町村合併調査研究会」設置 |
| 2002年5月10日 | 研究会「熊毛地区市町村合併調査研究会」を解散 |
| 2002年9月20日 | 西之表市,中種子町,南種子町は3市町での任意協議会設置で合意 |
| 2002年10月1日 | 西之表市と3市町で任意協議会「種子島地区任意合併協議会」設置 |
| 2003年7月 | 南種子町の合併に関する住民アンケートの結果 |
| 合併の是非：「賛成(43％)」「反対(56％)」 |
| 枠組み：「中種子町(70％)」「西之表市,中種子町(28％)」 |
| 新市役所の設置位置などを巡り協議が難航 |
| 2003年10月31日 | 任意協議会「種子島地区任意合併協議会」を解散 |
| 西之表市は単独市制継続へ |
| 2004年2月17日 | 2町で任意協議会「種子島二町任意合併協議会」設置 |
| 2004年5月 | 南種子町の中種子町との合併の是非を問う住民アンケートの結果 |
| 合併の是非：「賛成(33.3％)」「反対(64％)」 |
| 新庁舎の位置：「2町の中央(81.2％)」「中種子町役場と南種子町役場を2年交代で本庁舎とする(16％)」 |
| 2004年7月1日 | 法定協議会設置 |
| 2005年2月20日 | 合併の是非を問う住民投票の結果 |
| 中種子町：「賛成(80％)」「反対(20％)」 |
| 南種子町：「賛成(41％)」「反対(59％)」 |
| 合併予定期日：2006年3月27日 |
| 新町名公募上位10点：種子島,中南(ちゅうなん),種子(たね),新種子(しんたね),中南種子(なかみなみたね),たねがしま,つまべに,宇宙(うちゅう),種子島中南(たねがしまちゅうなん),南種子島 |
| 新町名最終候補5点：種子島,中南,種子,新種子,たねがしま |
| 新町名：種子島町(たねがしまちょう) |
| 新町役場：旧・南界中学校跡(中種子町) |
| 2005年2月28日 | 2町での合併を断念,協議会を解散 |
