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[87781]グリグリさん
ダイヤ改正の目玉として「○○から××まで最速２時間５８分」なんて宣伝を見ることもあるし、最短時間に注目するのも面白いのは確かです。

「きちんとやる」
理屈上は、０時００分から２３時５９分までを１分単位で検索すれば、どの便が本当に最短かは判明します（少なくとも『乗換案内』が対象としている交通手段の範囲では）。手間がかかるといっても、手作業でやるのでなくプログラムを組めば解決する話なのかもしれません。
ランキングにするとしても、[87771]（Ｎさん）の調査結果を見ると、５分や１０分の違いであっても順位に影響してくるように思います。航空機どうしなら接続の組み合わせの総当たりも大したことはありませんが、「移動区間の一部で最速の特急列車を使うパターンが全体としても最短」と単純に言えるのでしょうか？

[87779]Ｎさんのおっしゃるような、早朝に徒歩で少し郊外の駅まで歩くという可能性は考えていませんでした。夜明けまでに何ｋｍでも歩いていいのかといえば、それは本来の趣旨とは違いそうですね。これは確かに問題です。