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[97019]白桃さん
総務省統計局によると、
なお、人口集中地区の所在地や正確な境界の位置を必要とする場合は、e-Statに掲載されている「平成27年国勢調査　小地域集計結果第1表」を参照し、総務省統計局、都道府県又は市区町村で保管している「平成27年国勢調査　調査区地図」等を閲覧してください。
とあります。おそらく地理院地図で提供されているDIDの領域はe-Stat内「地図で見る統計」サイトのものと同一と思われますが、リンク先にもあるように"簡易な"ものに過ぎないため、実際には繋がっている可能性が高い、ということなのでしょう。

e-Stat内の「地図で見る統計」サイトには、国勢調査小地域統計のshapeファイルをはじめとする興味深い資料が多数あるのですが、稀にそのデータの中に誤りと思われる部分を見つけることもあります。こういった誤りの可能性があるデータの正誤を確かめたくて「国勢調査　調査区地図」を閲覧してみたいと思ったことがあるのですが、総務省のサイトには
国勢調査の調査区地図及び調査区一覧表は，市区町村内の町丁・字等別の地域範囲や調査区の境界確認に用いるものです。これらは，所定の手続を行った上で，総務省統計図書館及び都道府県，市区町村の統計主管課で閲覧できます。
としか記載が無く、"所定の手続"が全く分からず諦めたことがあります。

いずれにせよ、DIDが繋がっているかを確認するには「国勢調査　調査区地図」にあたるしか無いようです。